中国科学家自主完成首个果树作物基因组序列图谱

来源:中新网 2012-03-21 17:01 / 海峡都市报电子版

　　海都闽南网讯中新社武汉3月21日电 (记者艾启平)华中农业大学21日对外公布一项重大科研成果：由该校中国工程院院士邓秀新领衔的研究团队完成了甜橙基因组拼接与注释，获得了较高质量的甜橙基因组。这是中国自主完成的首个果树作物基因组序列图谱，也是目前全球最完整的甜橙基因组图谱。

　　柑橘是世界重要的果树之一，而甜橙是世界第一大柑橘类型，其产量占全世界柑橘产量的60%左右。中国是世界上重要的柑橘原生中心，从2008年起，无论是从种植总面积还是总产量，中国已经超越巴西成为世界柑橘第一大生产国。

　　专家称，甜橙具有多胚、遗传背景高度杂合等特点，阻碍了遗传学及育种发展。完整的基因组信息，作为一个遗传框架，将为柑橘遗传与育种改良提供依据。

　　据介绍，甜橙基因组计划于2011年启动。该基因组测序采用全基因组鸟枪法策略，分别构建了多个不同插入片段长度的文库，进行双末端测序。拼装后的序列覆盖87%的柑橘基因组，获得注释的基因约3万个。通过遗传标记和染色体原位杂交分析，将基因组序列整合到9条染色体。专家研究发现，甜橙基因组中有51%的基因位点处于杂合状态。

　　邓秀新院士介绍，甜橙基因组的完成，将为国内外同行研究芸香科(柑橘)的特殊生物学性状、功能基因组提供重要平台。同时，对于果实包括色、香、味、成熟期等重要性状基因的发掘及品种改良具有重要意义。这一重要成果发表在http://citrus.hzau.edu.cn网站上，为国内外学术研究提供免费数据分析。

　　目前，果树作物包括葡萄、番木瓜、苹果、草莓、可可、椰枣等基因组，国际上已发表。国际柑橘基因组计划2003年启动，2011年1月释放了克里曼丁橘的基因组草图。但克里曼丁橘主要在地中海地区栽培，其产量只占柑橘总产量10%。因此，美国、巴西和中国等国科学家都期望获得高质量的甜橙基因组图谱。